Les mycoses sont des infections provoquées par des champignons microscopiques touchant la peau glabre, les plis ou les phanères.
L’épidémiologie de ces infections est conditionnée par les rapports de l’être humain avec l’environnement, les animaux, ou par les contacts interhumains directs.
L’incidence de ces pathologies peut être notable, puisqu’on estime qu’en Europe 20 à 30% de la population est atteinte d’onychomycose (atteinte des ongles).
Les atteintes cutanées voient leur fréquence influencée par l’âge, les activités professionnelles et sportives, le contact avec les animaux ou l’existence de pathologies sous-jacentes (diabète, immunodépression, traitements immunosuppresseurs.).
Le biologiste, dans la démarche diagnostique de telles infections, intervient dès l’étape d’identification et de localisation de la lésion suspecte grâce à un examen clinique attentif. Son rôle est primordial lors du prélèvement afin d’assurer une qualité optimale de celui-ci.
Un examen direct microscopique extemporané rapide (48h) apportera une première réponse au clinicien.
La positivité de celui-ci permettra l’instauration d’une thérapeutique antifongique rapide et adaptée.
Cet examen direct demeure le seul moyen de confirmer la réalité de l’infection fongique 
lorsqu’une thérapeutique antifongique empirique a été débutée.
En parallèle, la mise en culture des échantillons biologiques recueillis sur des milieux 
spécifiques, permettra d’identifier avec précision l’agent fongique impliqué dans des délais parfois assez longs (4 semaines).
Le choix thérapeutique sera alors conforté par cette identification et conditionnera la 
surveillance ultérieure de l’évolution de la lésion.